Dr.-Ing. Stephan Allgeier

  • Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
    Institut für Automation und angewandte Informatik (IAI)

    Hermann-von-Helmholtz-Platz 1
    76344 Eggenstein-Leopoldshafen

    Fax: +49 721 608 22602
    Gebäude-Nr.: 445 / 449 / 668

Publikationen


2024
On the reproducibility of extrusion-based bioprinting: round robin study on standardization in the field
Grijalva Garces, D.; Strauß, S.; Gretzinger, S.; Schmieg, B.; Jüngst, T.; Groll, J.; Meinel, L.; Schmidt, I.; Hartmann, H.; Schenke-Layland, K.; Brandt, N.; Selzer, M.; Zimmermann, S.; Koltay, P.; Southan, A.; Tovar, G. E. M.; Schmidt, S.; Weber, A.; Ahlfeld, T.; Gelinsky, M.; Scheibel, T.; Detsch, R.; Boccaccini, A. R.; Naolou, T.; Lee-Thedieck, C.; Willems, C.; Groth, T.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Friedrich, T.; Briesen, H.; Buchholz, J.; Paulus, D.; von Gladiss, A.; Hubbuch, J.
2024. Biofabrication, 16 (1), Art.-Nr.: 015002. doi:10.1088/1758-5090/acfe3b
2023
Chromatic Swept-Source Laser Scanning - Konzept für eine zellauflösende konfokale Laserspaltlampe? [Chromatic Swept-Source Laser Scanning - Concept for a Cell-Resolving Confocal Laser Slit Lamp?]
Sperlich, K.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Stolz, H.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.; Allgeier, S.
2023. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 240 (12), 1375 – 1382. doi:10.1055/a-2184-9382
Towards the big picture - Fusion of large image datasets
Allgeier, S.
2023, September 29. 121. Kongress der Deutschen Ophthalmologischen Gesellschaft (DOG 2023), Berlin, Deutschland, 28. September–1. Oktober 2023
Longitudinal evaluation of the subbasal nerve plexus at identical corneal regions by large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R.; Stachs, O.
2023. Investigative ophthalmology & visual science, 64 (8), Art.-Nr.: 4025
Taxane-Induced Neuropathy and Its Ocular Effects—A Longitudinal Follow-up Study in Breast Cancer Patients
Stache, N.; Bohn, S.; Sperlich, K.; George, C.; Winter, K.; Schaub, F.; Do, H.-V.; Röhlig, M.; Reichert, K.-M.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Stachs, A.; Sterenczak, K. A.
2023. Cancers, 15 (9), Art.-Nr.: 2444. doi:10.3390/cancers15092444
2022
Mosaic vs. Single Image Analysis with Confocal Microscopy of the Corneal Nerve Plexus for Diagnosis of Early Diabetic Peripheral Neuropathy
Matuszewska-Iwanicka, A.; Stratmann, B.; Stachs, O.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Winter, K.; Guthoff, R.; Tschoepe, D.; Hettlich, H.-J.
2022. Ophthalmology and Therapy, 11 (6), 2211–2223. doi:10.1007/s40123-022-00574-z
Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2022, September 29. 120. Deutsche Ophthalmologische Gesellschaft e.V.: Kongress (DOG-Kongress 2022), Berlin, Deutschland, 29. September–2. Oktober 2022
Volume registration of in vivo confocal microscopy datasets of the human cornea - a comparison of two novel approaches
Allgeier, S.; Bohn, S.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2022, September 28. 14th Joint Annual Conference of the Austrian (ÖGBMT), German (VDE DGBMT) and Swiss (SSBE) Societies for Biomedical Engineering (BMT 2022), Innsbruck, Österreich, 28.–30. September 2022
Abstractband DOG 2022; Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R., F.; Stachs, O.
2022. Die Ophthalmologie, 119 (S3), 157–344. doi:10.1007/s00347-022-01723-2
Real-time large-area imaging of the corneal subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Guthoff, R. F.; Hagenmeyer, V.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stache, N.; Stachs, O.; Köhler, B.
2022. Scientific reports, 12, Article no: 2481. doi:10.1038/s41598-022-05983-5
Utilizing static corneal landmarks to assess dynamic corneal nerve changes by in vivo large-area confocal microscopy
Bohn, S.; Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2022. Der Ophthalmologe, 119 (Suppl 3), 170
Assessment of dynamic corneal nerve changes using static landmarks by in vivo large-area confocal microscopy—a longitudinal proof-of-concept study
Stache, N.; Sterenczak, K. A.; Sperlich, K.; Marfurt, C. F.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Mikut, R.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Stachs, A.; Stachs, O.; Bohn, S.
2022. Quantitative Imaging in Medicine and Surgery, 12 (10), 4734–4746. doi:10.21037/qims-22-15
In vivo monitoring of corneal dendritic cells in the subbasal nerve plexus during Trastuzumab and Paclitaxel breast cancer therapy - a one-year follow-up
Bohn, S.; Stache, N.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Bartschat, A.; Do, H.-V.; George, C.; Guthoff, R. F.; Stachs, A.; Stachs, O.; Sterenczak, K. A.
2022. Diagnostics, 12 (5), 1180. doi:10.3390/diagnostics12051180
2021
Wide-field mosaics of the corneal subbasal nerve plexus in Parkinson’s disease using in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Allgeier, S.; Scarpa, F.; Andréasson, M.; Bartschat, A.; Mikut, R.; Colonna, A.; Bellisario, M.; Utheim, T. P.; Köhler, B.; Svenningsson, P.; Lagali, N.
2021. Scientific data, 8 (1), Article no: 306. doi:10.1038/s41597-021-01087-3
The effects of pattern screen surface deformation on deflectometric measurements - A simulation study
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2021. Automated Visual Inspection and Machine Vision IV: SPIE Optical Metrology, 21-26 June 2021. Ed.: J. Beyerer, Art.-Nr.: 1178708, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2591877
Morphological characterization of the human corneal epithelium by in vivo confocal laser scanning microscopy
Sterenczak, K. A.; Winter, K.; Sperlich, K.; Stahnke, T.; Linke, S.; Farrokhi, S.; Klemm, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Guthoff, R. F.; Bohn, S.; Stachs, O.
2021. Quantitative imaging in medicine and surgery, 11 (5), 1737–1750. doi:10.21037/qims-20-1052
Parkinson’s disease with restless legs syndrome - an in vivo corneal confocal microscopy study
Andréasson, M.; Lagali, N.; Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Scarpa, F.; Colonna, A.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Solders, G.; Samuelsson, K.; Zetterberg, H.; Blennow, K.; Svenningsson, P.
2021. npj Parkinson’s Disease, 7 (1), Art.-Nr. 4. doi:10.1038/s41531-020-00148-5
Influence of contact cap design on large-area imaging of the subbasal nerve plexus
Bohn, S.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Reichert, K.-M.; Kornelius, L.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2021. Biomedical engineering, 66 (s1), S124. doi:10.1515/bmt-2021-6018
A software framework for real-time image mosaicking of the corneal subbasal nerve plexus
Köhler, B.; Kornelius, L.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Allgeier, S.
2021. Biomedical engineering, 66 (s1), S121
Burst of corneal dendritic cells during Trastuzumab and Paclitaxel treatment
Sterenczak, K. A.; Stache, N.; Bohn, S.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Bartschat, A.; George, C.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.; Stachs, A.
2021. Diagnostics, 11 (5), Art.Nr. 838. doi:10.3390/diagnostics11050838
Atypical cellular elements of unknown origin in the subbasal nerve plexus of a diabetic cornea diagnosed by large-area confocal laser scanning microscopy
Sterenczak, K. A.; Stachs, O.; Marfurt, C.; Matuszewska-Iwanicka, A.; Stratmann, B.; Sperlich, K.; Guthoff, R. F.; Hettlich, H.-J.; Allgeier, S.; Stahnke, T.
2021. Diagnostics, 11 (2), Article no: 154. doi:10.3390/diagnostics11020154
2020
In vivo Histology of the Cornea – from the “Rostock Cornea Module” to the “Rostock Electronic Slit Lamp” – a Clinical “Proof of Concept” Study
Bohn, S.; Stahnke, T.; Sperlich, K.; Linke, S. J.; Farrokhi, S.; Klemm, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Witt, M.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.
2020. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 237 (12), 1442–1454. doi:10.1055/a-1297-4717
3D Imaging Technique for High-Resolution Slit Lamp Microscopy in Ophthalmology
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2020. Biomedical engineering, 65 (s1), S126
Automated fabrication of hybrid printed electronic circuits
Gengenbach, U.; Ungerer, M.; Koker, L.; Reichert, K.-M.; Stiller, P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Zhu, X.; Huang, C.; Hagenmeyer, V.
2020. Mechatronics, 70, 102403. doi:10.1016/j.mechatronics.2020.102403
3D imaging technique for high-resolution slit lamp microscopy in ophthalmology
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Köhler, B.
2020, September. 54th Annual Conference of the German Society for Biomedical Engineering (DGBMT 2020), Online, 29. September–1. Oktober 2020
Reproducibility of two calibration procedures for phase-measuring deflectometry
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2020. Interferometry XX : 24 August - 4 September 2020, online only, United States. Ed.: M.B. North Morris, 14, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2567092
2019
Fuzzy tissue detection for real-time focal control in corneal confocal microscopy = Fuzzy-Gewebeerkennung für Echtzeit-Fokusregelung in der Kornea-Konfokalmikroskopie
Bartschat, A.; Allgeier, S.; Scherr, T.; Stegmaier, J.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Kuijper, A.; Reischl, M.; Stachs, O.; Köhler, B.; Mikut, R.
2019. Automatisierungstechnik, 67 (10), 879–888. doi:10.1515/auto-2019-0034
Volume reconstruction of the human cornea with oscillating focus scans
Kornelius, L.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stachs, O.; Köhler, B.
2019. Biomedical engineering, 64 (s2), S193. doi:10.1515/bmt-2019-6023
Robust phase unwrapping based on non-coprime fringe pattern periods for deflectometry measurements
Allgeier, S.; Gengenbach, U.; Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Hagenmeyer, V.
2019. Automated Visual Inspection and Machine Vision III - SPIE Optical Metrology, 2019, Munich, Germany, 24-27 JUNE 2019. Ed.: J. Beyerer, F. Puente León, 1106103, Society of Photo-optical Instrumentation Engineers (SPIE). doi:10.1117/12.2523564
Digitale Bildverarbeitung und Tiefe Neuronale Netze in der Augenheilkunde – aktuelle Trends - Digital Image Processing and Deep Neural Networks in Ophthalmology – Current Trends
Bartschat, A.; Allgeier, S.; Bohn, S.; Scherr, T.; Blessing, D.; Reichert, K.-M.; Reischl, M.; Stachs, O.; Koehler, B.; Mikut, R.
2019. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 236 (12), 1399–1406. doi:10.1055/a-1008-9400
2018
3D confocal laser-scanning microscopy for large-area imaging of the corneal subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Walckling, M.; Hagenmeyer, V.; Mikut, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2018. Scientific reports, 8 (1), Article Number 7468. doi:10.1038/s41598-018-25915-6
Corneal Subbasal Nerve Plexus Changes in Severe Diabetic Charcot Foot Deformity: A Pilot Study in Search for a DNOAP Biomarker
Herlyn, A.; Prakasam, R. K.; Peschel, S.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Guthoff, R. F.; Mittlmeier, T.; Stachs, O.
2018. Journal of diabetes research, 2018, Art. Nr.: 5910639. doi:10.1155/2018/5910639
Cross-sectional image quality improvements in 3D corneal confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Prakasam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018, September 27. 116. Deutsche Ophthalmologische Gesellschaft e.V.: Kongress (DOG-Kongress 2018), Bonn, Deutschland, 27.–30. September 2018
Analysis of focus shift speed for in vivo 3D corneal confocal microscopy
Allgeier, S.; Bartschat, A.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Mikut, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2018. Biomedical engineering, 63 (s1), S192. doi:10.1515/bmt-2018-6037
Cellular in vivo 3D imaging of the cornea by confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Prakasam, R.; Reichert, K.-M.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2018. Biomedical optics express, 9 (6), 2511–2525. doi:10.1364/BOE.9.002511
Cross-sectional image quality improvements in 3D corneal confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Prakasam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018. Der Ophthalmologe, 115 (Suppl 1), 74
Slit lamp microscopy on a cellular level using in vivo confocal laser scanning microscopy
Bohn, S.; Sperlich, K.; Kala Praksam, R.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bartschat, A.; Stolz, H.; Guthoff, R. F.; Köhler, B.; Mikut, R.; Stachs, O.
2018. Investigative ophthalmology & visual science, 59 (9), 3439
Wide-field corneal subbasal nerve plexus mosaics in age-controlled healthy and type 2 diabetes populations
Lagali, N. S.; Allgeier, S.; Guimarães, P.; Badian, R. A.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L. B.; Rolandsson, O.
2018. Scientific data, 5, Art.Nr. 180075. doi:10.1038/sdata.2018.75
The corneal subbasal nerve plexus and thickness of the retinal layers in pediatric type 1 diabetes and matched controls
Götze, A.; Keyserlingk, S. von; Peschel, S.; Jacoby, U.; Schreiver, C.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Winter, K.; Röhlig, M.; Jünemann, A.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Fischer, D.-C.
2018. Scientific reports, 8 (1), Art.Nr. 14. doi:10.1038/s41598-017-18284-z
2017
Reduced Corneal Nerve Fiber Density in Type 2 Diabetes by Wide-Area Mosaic Analysis
Lagali, N. S.; Allgeier, S.; Guimarães, P.; Badian, R. A.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L. B.; Rolandsson, O.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (14), Art.Nr. 6318. doi:10.1167/iovs.17-22257
Mosaicking the subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. Acta ophthalmologica, 95 (Suppl.), S259. doi:10.1111/j.1755-3768.2017.03122
Quantification of inflammatory cells in the corneal sub-basal layer in type 2 diabetes by in vivo confocal microscopy (IVCM)
Badian, R. A.; Utheim, T.; Allgeier, S.; Liu, X.; Köhler, B.; Lagali, N. S.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (8), 3535
Augmentations of the Bag of Visual Words Approach for Real-Time Fuzzy and Partial Image Classification
Bartschat, A.; Stegmaier, J.; Allgeier, S.; Reichert, K.-M.; Bohn, S.; Stachs, O.; Köhler, B.; Mikut, R.
2017. Proceedings. 27. Workshop Computational Intelligence, Dortmund, 23. - 24. November 2017. Hrsg.: F. Hoffmann, 227–242, KIT Scientific Publishing
Rechnergesteuerte Fokusnachführung zur großflächigen Abbildung des subbasalen Nervenplexus als Biomarker für diabetische Neuropathie
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat. A.; Reichert, K. M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2017. Der Ophthalmologe, (Suppl.2), S32
Rechnergesteuerte Fokusnachführung zur großflächigen Abbildung des subbasalen Nervenplexus als Biomarker für diabetische Neuropathie
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat. A.; Reichert, K. M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Guthoff, R.; Mikut, R.; Köhler, B.; Stachs, O.
2017. 115.DOG-Kongress, Berlin, 28.September - 1.Oktober 2017
Computer-controlled analysis of solid state nuclear track detectors
Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Fesenbeck, I.; Naber, C.; Allgeier, S.
2017. Biomedizinische Technik, 62 (S1), S506
Computer-controlled analysis of solid state nuclear track detectors
Köhler, B.; Reichert, K.-M.; Fesenbeck, I.; Naber, C.; Allgeier, S.
2017. 51. Jahrestagung der Biomedizinischen Technik und Dreiländertagung der Medizinischen Physik (BMT 2017), Dresden, Deutschland, 10.–13. September 2017
Concepts for automated fast focal plane control in subbasal nerve plexus mosaicking to reliably quantify a biomarker for diabetic peripheral neuropathy
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Stachs, O.
2017. Investigative ophthalmology & visual science, 58 (8), Art. Nr.: 1431
Mosaicking the subbasal nerve plexus
Allgeier, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. European Association for Vision and Eye Research (EVER) Congress 2017, Nice, F, September 27-30, 2017
Concepts for automated fast focal plane control in subbasal nerve plexus mosaicking to reliably quantify a biomarker for diabetic peripheral neuropathy
Bohn, S.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R.; Köhler, B.; Mikut, R.; Reichert, K.-M.; Sperlich, K.; Stolz, H.; Stachs, O.
2017. ARVO Annual Meeting, Baltimore, MD, May 7-11, 2017
Spatial analysis improves the detection of early corneal nerve fiber loss in patients with recently diagnosed type 2 diabetes
Ziegler, D.; Winter, K.; Strom, A.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Ringel, B.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2017. PLoS one, 12 (3), e0173832. doi:10.1371/journal.pone.0173832
In-vivo-Bildgebung des kornealen Nervenplexus : Vom Einzelbild zur großflächigen Darstellung
Köhler, B.; Allgeier, S.; Bartschat, A.; Guthoff, R. F.; Bohn, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Winter, K.; Mikut, R.
2017. Der Ophthalmologe, 114 (7), 601–607. doi:10.1007/s00347-017-0464-4
Morphometrische Charakterisierung des subbasalen Nervenplexus, Detektion und Analyse von Nervenfasernetzwerken
Winter, K.; Scheibe, P.; Guthoff, R. F.; Allgeier, S.; Stachs, O.
2017. Der Ophthalmologe, 114 (7), 608–616. doi:10.1007/s00347-017-0465-3
Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by in vivo confocal microscopy and histological staining
Kowtharapu, B. S.; Winter, K.; Marfurt, C.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Hovakimyan, M.; Stahnke, T.; Wree, A.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.
2017. Eye, 31, 481–490. doi:10.1038/eye.2016.220
A Novel Approach to Analyze the Progression of Measured Corneal Sub-Basal Nerve Fiber Length in Continuously Expanding Mosaic Images
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2017. Current eye research, 42 (4), 549–556. doi:10.1080/02713683.2016.1221977
2016
Quantitative analysis of central corneal sub-basal inflammatory cells and dendritic cells in large-area mosaic images obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Lagali, N.
2016. Investigative ophthalmology & visual science, 57 (12), 1929
Analysis of corneal subbasal nerve plexus from wide-area mosaics in healthy subjects and in type 2 diabetics
Lagali, N.; Allgeier, S.; Guimaraes, P.; Badian, R.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L.; Rolandsson, O.
2016. Investigative ophthalmology & visual science, 57 (12), Art. Nr. 6158
Automatic corneal tissue classification using bag-of-visual-words approaches
Bartschat, A.; Toso, L.; Stegmaier, J.; Kuijper, A.; Mikut, R.; Köhler, B.; Allgeier, S.
2016. Forum Bildverarbeitung 2016. Hrsg.: M. Heizmann, 245–256, KIT Scientific Publishing
Analysis of corneal subbasal nerve fiber length in mosaic image series acquired by guided eye movements
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. R.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2016. Biomedizinische Technik, 61 (Suppl.1), 148. doi:10.1515/bmt-2016-5013
Analysis of corneal subbasal nerve fiber length in mosaic image series acquired by guided eye movements
Allgeier, S.; Winter, K.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. R.; Peschel, S.; Reichert, K.-M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2016. „Dreiländertagung“ of Biomedical Engineering, Basel, CH, October 4-6, 2016
EyeGuidance - a computer controlled system to guide eye movements
Köhler, B.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Reichert, K.-M.; Sieber, I.; Stachs, O.; Toso, L.; Allgeier, S.
2016. Current directions in biomedical engineering, 2 (1), 433–436. doi:10.1515/cdbme-2016-0096
EyeGuidance - a computer controlled system to guide eye movements
Köhler, B.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Reichert, K.-M.; Sieber, I.; Stachs, O.; Toso, L.; Allgeier, S.
2016. „Dreiländertagung“ of Biomedical Engineering, Basel, CH, October 4-6, 2016
Quantitative analysis of central corneal sub-basal inflammatory cells and dendritic cells in large-area mosaic images obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Lagali, N.
2016. ARVO 2016 Annual Meeting, Seattle, WA, May 1-5, 2016
Analysis of corneal subbasal nerve plexus from wide-area mosaics in healthy subjects and in type 2 diabetics
Lagali, N.; Allgeier, S.; Guimaraes, P.; Badian, R.; Ruggeri, A.; Köhler, B.; Utheim, T. P.; Peebo, B.; Peterson, M.; Dahlin, L.; Rolandsson, O.
2016. ARVO 2016 Annual Meeting, Seattle, WA, May 1-5, 2016
Local Variability of Parameters for Characterization of the Corneal Subbasal Nerve Plexus
Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2016. Current eye research, 41 (2), 186–198. doi:10.3109/02713683.2015.1010686
2015
Quantitative analysis of corneal sub-basal nerve plexus and inflammatory cells in large-area mosaics obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Ruggeri, A.; Poletti, E.; Guimares, P.; Lagali, N. S.
2015. Investigative ophthalmology & visual science, 56 (7), 1637
Quantitative analysis of corneal sub-basal nerve pexus and inflammatory cells in large-area mosaics obtained by in vivo confocal microscopy
Badian, R. A.; Utheim, T. P.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Ruggeri, A.; Poletti, E.; Guimares, P.; Lagali, N. S.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, CO, May 3-7, 2015
Local variability of parameters for characterization of the corneal sub-basal nervePlexus
Stachs, O.; Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.
2015. Investigative Ophtalmology and Visual Science, 56 (7), 1636
Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by histologic staining and in vivo confocal microscopy
Guthoff, R. F.; Kowtharapu, B. S.; Hovakimyan, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Stahnke, T.; Marfurt, C. F.; Stachs, O.
2015. Investigative Ophthalmology and Visual Science, 56 (7), 3071
Local variability of parameters for characterization of the corneal sub-basal nerve plexus
Stachs, O.; Winter, K.; Scheibe, P.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, Colo., May 3-7, 2015
Comparative quantitative assessment of the human corneal sub-basal nerve plexus by histologic staining and in vivo confocal microscopy
Guthoff, R. F.; Kowtharapu, B. S.; Hovakimyan, M.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Winter, K.; Stahnke, T.; Marfurt, C.; Stachs, O.
2015. ARVO Annual Meeting 2015, Denver, Colo., May 3-7, 2015
Iterative algorithms to generate large scale mosaic images
Toso, L.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Köhler, B.
2015. Bildverarbeitung für die Medizin 2015 : Algrithmen, Systeme, Anwendungen ; Proceedings des Workshops, Lübeck, 15.-17.März 2015. Ed.: H. Handels, 203–208, Springer Verlag
Iterative algorithms to generate large scale mosaic images
Toso, L.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Köhler, B.
2015. Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Lübeck, 15.-17.März 2015
2014
Großflächige Abbildung kornealer Nervenfasern durch geführte Augenbewegungen
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.
2014. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 231, 1170–1173. doi:10.1055/s-0034-1383331
Early detection of nerve fiber loss by corneal confocal microscopy and skin biopsy in recently diagnosed type 2 diabetes
Ziegler, D.; Papanas, N.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Strom, A.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2014. (German Diabetes Study (GDS) Group., Hrsg.) Diabetes, 63 (7), 2454–2463. doi:10.2337/db13-1819
Mosaicking the subbasal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Maier, S.; Mikut, R.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Köhler, B.
2014. Investigative Ophthalmology & Visual Science, 55 (9), 6082–6089. doi:10.1167/iovs.14-14698
Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Köhler, B.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Wezel, J. van; Mikut, R.; Bretthauer, G.
2014. Biomedizinische Technik, 59 (s1), s572
Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus by guided eye movements
Allgeier, S.; Köhler, B.; Maier, S.; Peschel, S.; Reichert, K. M.; Stachs, O.; Wezel, J. van; Mikut, R.; Bretthauer, G.
2014. BMT 2014 : 48.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Hannover, 8.-10.Oktober 2014
Advances in in vivo imaging of corneal nerves
Stachs, O.; Kowtharapu, B. S.; Allgeier, S.; Winter, K.; Köhler, B.
2014. Vision and Diabetes : Leopoldina Symposium, Rostock, March 15-16, 2013 Halle : Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina. Hrsg.: R. F. Guthoff, 115–126, Wissenschaftliche Verlags-Gesellschaft
Software-based imaging and quantitative analysis of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2014. Vision and Diabetes : Leopoldina Symposium, Rostock, March 15-16, 2013 Halle : Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina. Hrsg.: R. F. Guthoff, 127–142, Wissenschaftliche Verlags-Gesellschaft
Large scale in vivo imaging of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Maier, S.; Reichert, K. M.; Peschel, S.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2014. 21st ISER Biennial Meeting, San Francisco, Calif., July 20-24, 2014
2013
Software-based imaging and segmentation of corneal nerve fibres
Winter, K.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2013. Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 58 (SUPPL.1). doi:10.1515/bmt-2013-4293
A confocal microscopy study of the anterior corneal mosaic in the sub-basal nerve plexus
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Van Wezel, J.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2013. Biomedizinische Technik, 58 (SUPPL.1). doi:10.1515/bmt-2013-4270
Software-based imaging and quantitative analysis of the corneal sub-basal nerve plexus
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2013. Leopoldina Symposium ’Vision and Diabetes’, Rostock, March 15-16, 2013
Erweiterte Darstellung des kornealen Nervenplexus durch Fusion meherer rekonstruierter Bilder zur zuverlässigen Beurteilung der Hornhautinnervation
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2013. Exzellent sehen - Exzellenz Fördern : 111.DOG-Kongress, Berlin, 19.-22.September 2013
Software-based imaging and segmentation of corneal nerve fibres
Winter, K.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2013. Dreiländertagung der Deutschen, Schweizerischen und Österreichischen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT 2013), Graz, A, 19.-21.September 2013
A confocal microscopy study of the anterior corneal mosaic in the sub-basal nerve plexus
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Wezel, J. van; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2013. Dreiländertagung der Deutschen, Schweizerischen und Österreichischen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (BMT 2013), Graz, A, 19.-21.September 2013
Characteristic Quantities of Corneal Epithelial Structures in Confocal Laser Scanning Microscopic Volume Data Sets
Prakasam, R. K.; Winter, K.; Schwiede, M.; Allgeier, S.; Zhivov, A.; Köhler, B.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2013. Cornea, 32 (5), 636–643. doi:10.1097/ICO.0b013e31826247bf
Characteristic quantities of corneal epithelial structures in confocal laser scanning microscopic volume datasets
Stachs, O.; Prakasam, R. K.; Winter, K.; Allgeier, S.; Köhler, B.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.
2013. ARVO Annual Meeting, Seattle, Wash., May 5-9, 2013
Confocal microscopy of corneal nerves for early detection of diabetic neuropathy in recently diagnosed type 2 diabetic patients
Zhivov, A.; Ziegler, D.; Peschel, S.; Allgeier, S.; Winter, K.; Koehler, B.; Papanas, N.; Stachs, O.; Roden, M.; Guthoff, R. F.
2013. ARVO Annual Meeting, Seattle, Wash., May 5-9, 2013
2012
Generating extended images of the corneal nerve plexus by guided eye movements
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Reichert, K.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2012. Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 57 (Suppl. 1), 322. doi:10.1515/bmt-2012-4202
Mosaicking images of the corneal sub-basal nerve plexus using hierarchical block-based image registration
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2012. Biomedizinische Technik, 57 (Suppl. 1), 30–33. doi:10.1515/bmt-2012-4201
Early detection of nerve fibre loss by corneal confocal microscopy and skin biopsy in recently diagnosed type 2 diabetic subjects
Ziegler, D.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Brüggemann, J.; Peschel, S.; Köhler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2012. 48th Annual Meeting of the European Association for the Study of Diabetes (EASD 2012), Berlin, October 2-5, 2012
Mosaicking images of the corneal sub-basal nerve plexus using hierarchical block-based image registration
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2012. BMT 2012 : 46.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Jena, 16.-19.September 2012
Generating extended images of the corneal nerve plexus by guided eye movements
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Reichert, K.; Stachs, O.; Bretthauer, G.
2012. BMT 2012 : 46.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Jena, 16.-19.September 2012
Early detection of nerve fiber loss by in vivo corneal confocal microscopy in recently diagnosed type 2 diabetic patients
Ziegler, D.; Zhivov, A.; Allgeier, S.; Winter, K.; Papanas, N.; Ziegler, I.; Peschel, S.; Koehler, B.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Roden, M.
2012. American Diabetes Association (ADA) 72nd Scientific Sessions, Philadelphia, Pa., June 8-12, 2012 Book of Abstracts
2011
Image Reconstruction of the Subbasal Nerve Plexus with In Vivo Confocal Microscopy
Allgeier, S.; Zhivov, A.; Eberle, F.; Koehler, B.; Maier, S.; Bretthauer, G.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2011. Investigative ophthalmology & visual science, 52 (9), 5022–5028. doi:10.1167/iovs.10-6065
Elastische Registrierung von in-vivo-CLSM-Aufnahmen der Kornea
Allgeier, S.; Köhler, B.; Eberle, F.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2011. Bildverarbeitung für die Medizin 2011 : Algorithmen, Systeme, Anwendungen; Proceedings des Workshops vom 20. bis 22. März 2011 in Lübeck. Hrsg.: H. Handels, 149–153, Springer Verlag
Generating Extended Images of the Corneal Sub-Basal Nerve Plexus In Vivo
Allgeier, S.; Köhler, B.; Bretthauer, G.; Stachs, O.
2011. Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 56 (Suppl. 1). doi:10.1515/BMT.2011.342
Bildrekonstruktion des subbasalen Nervenplexus der Kornea mit erweitertem Bildfeld aus Fokusserien eines konfokalen Laser-Scanning-Mikroskops
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Guthoff, R.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Ziegler, D.; Bretthauer, G.
2011. Klinische Monatsblätter für Augenheilkunde, 228 (12), 1060–1066. doi:10.1055/s-0031-1281959
Subdifferenzierung des Hornhautepithels - eine neue Methode zur Charakterisierung von Oberflächenerkrankungen des Auges
Perotta, A.; Köhler, B.; Allgeier, S.; Guthoff, R. F.; Stachs, O.
2011. Herausforderungen in der Augenheilkunde : 109.DOG-Kongress, Berlin, 29.September - 2.Oktober 2011
Generating extended images of the corneal sub-basal nerve plexus in vivo
Allgeier, S.; Köhler, B.; Bretthauer, G.; Stachs, O.
2011. BMT 2011 : 45.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Freiburg, 27.-30.September 2011 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 56(2011) Suppl.1 Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2011.342
Bildrekonstruktion aus CLSM-Bildserien zur Quantifizierung der Hornhautinnervation in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Stachs, O.; Winter, K.; Bretthauer, G.
2011. Herausforderungen in der Augenheilkunde : 109.DOG-Kongress, Berlin, 29.September - 2.Oktober 2011
Elastische Registrierung von in-vivo-CLSM-Aufnahmen der Kornea
Allgeier, S.; Köhler, B.; Eberle, F.; Maier, S.; Stachs, O.; Zhivov, A.; Bretthauer, G.
2011. Bildverarbeitung für die Medizin 2011 : Algorithmen - Systeme - Anwendungen, Lübeck, 20.-22.März 2011
2010
Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer G.
2010. Biomedizinische Technik, 55 (Suppl. 1). doi:10.1515/BMT.2010.564
Ein neues Bildverarbeitungsverfahren zur zuverlässigen Erfassung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 55(2010) Suppl.1, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.450
Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010 Biomedizinische Technik/Biomedical Engineering, 55(2010) Suppl.1, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.564
Quantification of confocal images of the subbasal nerve plexus of the cornea as a non-invasive staging parameter for diabetic neuropathy
Zhivov, A.; Winter, K.; Allgeier, S.; Guthoff, R.; Stachs, O.; Köhler, B.
2010. 20th Annual Meeting of the Diabetic Neuropathy study Group of the EASD (Neurodiab XX), Stockholm, S, September 17-19, 2010
Ein neues Bildverarbeitungsverfahren zur zuverlässigen Erfassung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Köhler, B.; Allgeier, S.; Eberle, F.; Maier, S.; Zhivov, A.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. Biomedizinische Technik / Supplement, BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010, Auch auf CD-ROM, 55 (S1), 178–81. doi:10.1515/BMT.2010.450
Ein neues Mosaikbildverfahren zur großflächigen Darstellung des subbasalen Nervenplexus der Kornea in vivo
Allgeier, S.; Eberle, F.; Köhler, B.; Maier, S.; Stachs, O.; Guthoff, R. F.; Bretthauer, G.
2010. Biomedizinische Technik / Supplement, BMT 2010 : 44.Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik (DGBMT), Rostock, 5.-8.Oktober 2010, Auch auf CD-ROM DOI:10.1515/BMT.2010.564, 55 (S1), 259–62. doi:10.1515/BMT.2010.701