Biohandling
- Ansprechperson:
- Projektgruppe:
- Projektbeteiligte:
KIT Screening Center des European Zebrafish Resource Center (EZRC), KIT Institute of Biological and Chemical Systems – Biological Information Processing (IBCS-BIP).
- Starttermin:
2018
Modellorganismen wie die Eier des Zebrafischs (Danio rerio) helfen die Entstehung von Tumoren und genetisch bedingten Erkrankungen besser zu verstehen und effektiver behandeln zu können. Um neue geeignete Medikamente oder Verfahren zur Behandlung dieser Erkrankungen zu finden, müssen die empfindlichen Eier zunächst sortiert und anschließend mikroskopiert werden. Beides kann durch den Einsatz speziell entwickelter Laborroboter automatisiert werden. Durch die Kopplung von fluoreszierenden Farbstoffen können zudem ganz gezielt Zellen gefärbt und besser sichtbar gemacht werden. Anschließend müssen alle Veränderungen von der normalen Entwicklung der Fischeier erkannt und mittels KI klassifiziert werden. Die dafür erforderlichen Roboter, Fluoreszenzmikroskope und Analysesoftware werden am IAI entwickelt.
Referenzen:
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Breitwieser, H.; Dickmeis, T.; Vogt, M.; Ferg, M.; Pylatiuk, C.: Fully Automated Pipetting Sorting System for Different Morphological Phenotypes of Zebrafish Embryos. SLAS TECHNOLOGY: Translating Life Sciences Innovation, 23(2):128–133, 2018. doi:10.1177/2472630317745780
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Neukum, A.; Bartschat, A.; Breitwieser, H.; Strähle, U.; Dickmeis, T.; Pylatiuk, C.: Automated Classification of Fertilized Zebrafish Embryos. Zebrafish, 16(3):326–328, 2019. doi:10.1089/zeb.2019.1728